Οι Bacillus είναι μια μεγάλη και ετερογενής συλλογή βακτηρίων, αερόβιων ή αναερόβιων, σε σχήμα ράβδου, που σχηματίζουν ενδοσπόρια και διανέμονται ευρέως σε όλο το περιβάλλον. Τα B. subtilis, B. licheniformis και B. pumilus έχουν αναγνωριστεί ως «αρχικά μέλη» του γένους Bacillus.
Το 1943, η Fukumoto απομόνωσε για πρώτη φορά το B. amyloliquefaciens, ένα βακτήριο που παράγει υγροποίηση της αμυλάσης από το έδαφος. Αργότερα, το B. amyloliquefaciens συνδυάστηκε με το B. licheniformis, B. pumilus και B. subtilis στο «B. subtilis σύμπλεγμα ειδών», βασισμένο σε φυλογενετικά και φαινολογικά στοιχεία. Αυτή η ταξινόμηση έγινε με βάση την εξαιρετικά διατηρημένη φύση των πρωτεϊνικών κωδικοποιητικών αλληλουχιών στο σύμπλεγμα ειδών του Β. Subtilis. Για πολλά χρόνια, αυτά τα στενά συγγενικά είδη ήταν δύσκολο να ταξινομηθούν χρησιμοποιώντας κλασικές ταξινομικές παραμέτρους όπως μορφολογία, φυσιολογικά χαρακτηριστικά, περιεκτικότητα σε γουανίνη-κυτοσίνη και φυλογενετική ανάλυση μέσω αλληλουχίας γονιδίου 16S rRNA.
Το 2007, το B. amyloliquefaciens FZB42 αναφέρθηκε ως το πρώτο gram-θετικό βακτηρίδιο βιολογικού ελέγχου που έχει το γονιδίωμα του σε αλληλουχία. Το στέλεχος φιλοξενεί μια σειρά από εννέα γιγαντιαίες συστάδες γονιδίων που λειτουργούν για να παράγουν ένα φάσμα βιοδραστικών δευτερευόντων μεταβολιτών με αρθρωτά οργανωμένα μεγάλα ένζυμα, γνωστά ως συνθετάσες μηριβοσωματικών πεπτιδίων και συνθετάσες πολυκετιδίων.
Το 2011, τα στελέχη B. amyloliquefaciens κατανεμήθηκαν μεταξύ των υποειδών B. amyloliquefaciens subsp. amyloliquefaciens και B. amyloliquefaciens subsp. plantarum, βασισμένο σε πλήρη ανάλυση γονιδιώματος. Το στέλεχος του B. amyloliquefaciens subsp. plantarum σχετίζεται με τα φυτά και συνήθως χρησιμοποιείται ως βιολογικός παράγοντας ελέγχου και / ή προαγωγός ανάπτυξης των φυτών.
Επιπλέον, συγκριτική γονιδιωματική ανάλυση του B. amyloliquefaciens subsp. plantarum και Β. methylotrophicus έδειξαν ότι τα γονιδιώματα ήταν πολύ παρόμοια (95%), με μόνο μικρές διαφορές εντός των γονιδιωματικών τους αλληλουχιών.
Επομένως, το B. amyloliquefaciens subsp. plantarum ήταν συνώνυμο με το B. Methylotrophicus, και διαδοχικά, το B. methylotrophicus συνώνυμο με το B. velezensis, λόγω της υψηλής φαινοτυπικής και γονοτυπικής συνοχής τους.
Bacillus
Bacillus
Bacillus
Ιωάννης Διβανές
Γεωπόνος MSc
i-CON.SHARE