Με την ολοκλήρωση της συγκομιδής και μέχρι τη φάση του πλήρους λήθαργου των δένδρων, το Υπουργείο Αγροτικής Ανάπτυξης και Τροφίμων συνιστά σειρά καλλιεργητικών μέτρων και φυτοπροστατευτικών επεμβάσεων. Οι μετασυλλεκτικές αυτές ενέργειες αποσκοπούν στη δραστική μείωση των πληθυσμών των εχθρών (εντόμων και ακάρεων), καθώς και στον περιορισμό των μολυσμάτων μυκητολογικών και βακτηριολογικών ασθενειών. Η εφαρμογή τους είναι απαραίτητη, καθώς καθιστά την καταπολέμηση των φυτοπαρασίτων κατά την επόμενη βλαστική περίοδο περισσότερο αποτελεσματική και οικονομική.
Για την αντιμετώπιση του εξώασκου σε ροδακινιά και νεκταρινιά, συνιστάται επιμελής ψεκασμός με εγκεκριμένο μυκητοκτόνο κατά τη διάρκεια του λήθαργου, δηλαδή μετά την πτώση των φύλλων έως το φούσκωμα των οφθαλμών. Παράλληλα, το κορύνεο σε ροδακινιά, νεκταρινιά, βερικοκιά, δαμασκηνιά και κερασιά, απαιτεί δύο ψεκασμούς, οι οποίοι καταπολεμούν ταυτόχρονα και τον εξώασκο. Ο πρώτος ψεκασμός γίνεται το φθινόπωρο κατά τη φυλλόπτωση και ο δεύτερος πριν τη διόγκωση των οφθαλμών. Πριν τους ψεκασμούς, πάντα με ξηρό καιρό, είναι απαραίτητη η αφαίρεση και η καύση των προσβεβλημένων κλάδων.
Ιδιαίτερα επικίνδυνη είναι η περίοδος του φθινοπώρου και του χειμώνα για την εκδήλωση βακτηριακού έλκους. Για την προστασία των δένδρων συνιστώνται δύο προληπτικοί ψεκασμοί: ένας στην έναρξη και ένας στο 75% της φυλλόπτωσης. Επιπλέον, είναι αναγκαία η αφαίρεση των προσβεβλημένων τμημάτων με ξηρό καιρό, καθώς και η προστασία των πληγών και των τομών κλαδέματος με κατάλληλα σκευάσματα.
Όσον αφορά τους εντομολογικούς εχθρούς, την εποχή αυτή δρα ο ανθονόμος, κυρίως σε ροδακινιά, νεκταρινιά και βερικοκιά, ο οποίος ζευγαρώνει και καταστρέφει τους οφθαλμούς τρεφόμενος και ωοτοκώντας σε αυτούς. Σε καλλιέργειες με υψηλό πληθυσμό συνιστάται άμεσος ψεκασμός με εγκεκριμένο εντομοκτόνο. Σε κάθε περίπτωση, οι παραγωγοί οφείλουν να τηρούν αυστηρά τις οδηγίες χρήσης των φυτοπροστατευτικών προϊόντων για την αποφυγή φυτοτοξικότητας και την προστασία της υγείας.
